בעוד שמגדלי תקשורת ומגדלי טלקום חולקים כמה קווי דמיון פונקציונליים, יש להם גם הבדלים.
שניהם משמשים לשידור וקליטה של אותות, התומכים בתקשורת אלחוטית. עם זאת, למגדלי תקשורת יש תפקיד רחב יותר. מלבד תמיכה בתקשורת קול ונתונים נפוצה, הם יכולים לשמש גם להעברת תקשורת בתעשיות ספציפיות, כגון רכבות ומוקשים, להבטיח העברת מידע בתעשיות אלה ולענות על צרכי התקשורת הספציפיים שלהם. מגדלי טלקום, לעומת זאת, מתמקדים בעיקר בתקשורת סלולרית ציבורית, תוך הבטחת העברת אותות בין מכשירים ניידים כגון טלפונים וטאבלטים ותחנות בסיס, ועונה על הצרכים היומיומיים של הציבור לשיחות קוליות ולגישה לאינטרנט.
לגבי סוגי העברת אותות, מגדלי תקשורת עשויים להתמודד עם אותות מקצועיים מורכבים יותר, כגון אותות תעשייתיים עם פרוטוקולים ספציפיים; מגדלי טלקום מעבירים בעיקר אותות תקשורת ניידת כללית.
מבחינת תרחישי יישום, מגדלי תקשורת נמצאים באזורי עבודה מקצועיים בתעשייה, בעוד שמגדלי טלקום נמצאים בתפוצה רחבה באזורים מאוכלסים בצפיפות או באזורים עם צרכי תקשורת, כגון ערים ואזורים כפריים.